蝙蝠当然是飞禽类。蝙蝠是脊索动物门、哺乳纲下的一类动物,是唯一能够真正飞翔的哺乳动物;除一般哺乳动物的特点外,还有一系列适应飞行的形态特征。蝙蝠具有很强的飞行能力。

蝙蝠是翼手目动物，翼手目是动物中仅次于啮齿目动物的第二大类群，是唯一一类演化出真正有飞翔能力的哺乳动物，现生物种类共有19科185属961种，除极地和大洋中的一些岛屿外，分布遍于全世界，在热带和亚热带蝙蝠最多。大部分蝙蝠都是白天休息，夜间觅食。

已知最早的蝙蝠化石是有5000万年历史的食指伊神蝠，是在美国怀俄明州发现的。后来发现德国的麦塞尔湖湖床层内有更完整的蝙蝠化石，这些化石可以追溯到始新世时期，它们的胃里包含有成了化石的昆虫。这些早期的蝙蝠有许多和现存的小蝙蝠亚目相似，因而很难重现它们进化中的早期阶段，但是它们耳蜗（内耳）的结构表明它们几乎肯定是使用回声定位的。最早的与大蝙蝠亚目相似的化石，可追溯到大约3500万年前。有些科学家提出，与小型蝙蝠相比，大型蝙蝠可能实际上与灵长类的关系更近。除了没有回声定位系统之外，大型蝙蝠和灵长类都有高级的视觉能力，而且它们指骨的长度也有相似的比例。科学家推测，翼手目两个亚目里是分别独立进化出来的，然而这一理论却无法得到分子学研究的证实。相反分子学研究证明了蝙蝠（翼手目）群体内的相似性，因为两个亚目的基因里都含有较高水平的腺嘌岭和胸腺嘧啶碱基对。支持“飞行的灵长类”观点的科学家反对上述观点，他们说基因的相似性可能仅仅是因为两个亚目在飞行中都需要消耗大量的能量，是进化动力在相似的条件下将它们独自塑造而成，而不是因为它们有一个近期的共同祖先。大部分分子学研究现在支持蝙蝠（翼手目）的单一起源理论，即狐蝠和小型蝙蝠有共同的祖先。